Nel corso del 1996, il reparto farmacie, che attualmente occupa 9 dipendenti (6 farmacisti e 3 collaboratori), ha servito quasi 100.000 clienti.
Nel 1997, con la collaborazione dell'Azienda USSL 30 di Desio, il reparto farmaceutico e sanitario ha organizzato un corso sulla corretta alimentazione rivolto a tutte le classi terze medie delle scuole pubbliche e private di Seregno.

AEB, per caratterizzare la natura pubblica del proprio reparto farmaceutico e sanitario aziendale, ha individuato dei servizi aggiuntivi di complemento nella sfera della salute, da fornire anche in collaborazione con le strutture sanitarie e le associazioni che hanno come finalità la tutela e la promozione della salute, tra cui il corso di informazione sopra citato.